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          微生物基因组重测序

          精准,高效,性价比高。

          一站式解析变异与差异

          微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,
          对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。
          微生物基因组的重测序,是基于小片段文库的高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法。
          检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息,以精准快捷为特点,
          系统全面的检测变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等深入研究。

          精准、快捷、多样化重测序方案

          微生物重测序产品,以精准快捷为核心,切中核心目标,
          准确检测菌株间的重要变异信息。

          产品 测序平台 测序策略 检测内容 项目周期
          细菌重测序 HiSeq PE150 350 bp文库 ≥ 100 X SNP、InDel、SV 30个自然日
          真菌重测序 HiSeq PE150 350 bp文库 ≥ 30 X SNP、InDel、SV 30个自然日

          科学方案设计

          从材料选取,建库测序,到数据分析,
          每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

          信息分析

          分析内容=标准分析+高级分析。
          深入到位的数据分析可系统、全面了解样本的信息。变异检测只是重
          测序的数据基础,基于数据的挖掘,才是解释生物学问题的桥梁。一
          系列的信息分析,帮助我们更好的解读数据,了解菌株进化、选择和
          传播等重要问题。

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          分析内容 解决问题
          变异检测 准确定位变异位点
          基本进化分析 构建系统进化树
          确定菌株间进化关系
          地域归属分析 研究菌株的地域传播规律
          分歧时间估计 讨论菌株支系之间的分化历史
          选择压力分析 菌株进化过程中的选择压力
          揭示与环境相关的关键基因
          变异基因功能富集 统计变异基因分布规律
          寻找变异丰富的功能分类

          悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

          微生物基因组重测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
          诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
          实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
          以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

          出色完成每一个项目环节

          诺禾致源微生物合作遍布全球,截止2015年12月,微生物重测序结题样品数超过500个,
          项目合作领域涵盖了致病菌、益生菌、食用菌、药用菌株、工业菌株等广泛领域。
          “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
          确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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