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          16S、18S、ITS等擴增子測序

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          16S、18S、ITS等擴增子測序

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          一步到位檢測環境微生物多樣性

          擴增子測序是對特定長度的PCR產物或捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。
          16S/18S/ITS等擴增子測序即通過提取環境樣品的DNA,選擇合適的通用引物擴增16S/18S/ITS的目標區域,
          通過檢測目標區域的序列變異和豐度,以研究環境微生物多樣性及群落組成差異。
          16S/18S rDNA為編碼原/真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列。
          ITS分為兩個區域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之間,ITS2位于5.8S和28S之間。

          讀長長, 周期短, 性價比高。

          采用Ion S5 XL測序平臺,以半導體測序技術為核心,直接將化學信號轉換成數字信號,
          單端測序,無需拼接,平臺重復性比Illumina測序平臺更好,
          SE400/SE600兩種模式,為擴增子測序提供更多的選擇。

          科學方案設計

          從材料選取,建庫測序,到數據分析,
          每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。

          信息分析

          分析內容=標準分析+高級分析。
          基于目標區域的測序,檢測序列豐度,以充分研究環境微生物多樣性和
          群落結構差異性。

          高級分析 解決問題
          腸型分析 腸道菌準確定位和疾病預測和治療
          PICRUSt 預測宏基因組的功能組成
          FAPROTAX 預測環境樣本的生物化學循環過程
          Tax4fun 腸道、土壤等樣品的功能預測
          FunGuild 預測真菌的生態功能
          標準分析 解決問題
          物種注釋 物種注釋及各物種豐度信息
          α-多樣性分析 微生物群落的豐富度和多樣性
          β-多樣性分析 不同樣本間的微生物群落
          及各樣本差異情況
          多元統計分析 尋找組間具有顯著差異的物種,
          同時可以比較組內差異和組間差異
          的大小,判斷分組是否有意義
          CCA分析 研究物種組成與環境因子間的關系
          環境因子關聯分析
          VPA分析

          擴增子測序解密環境微生物多樣性

          諾禾致源基于多樣性的測序區域選擇,結合研究目的和樣品自身的特點,
          靈活制定研究方案,用專業成熟的樣本
          制備、建庫以及數據分析流程,客觀還原樣品本身的菌群結構以及豐度。

          悅讀高質量測序數據,盡享HPC澎湃動力

          擴增子測序采用先進的Ion S5 XL測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
          諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,
          實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,
          以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。

          項目經驗豐富

          至2017年12月,諾禾致源諾禾16S樣本數突破220,000例,
          包括土壤、水體、糞便、淤泥、發酵物等樣本。
          “科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”
          確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。

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